Analyzujeme a porovnáváme molekulární mechanismy regulující fotosyntetické procesy jako je disipace zachycené energie, diazotrofie nebo alokace energie do metabolických procesů u ekologicky významných, ale evolučně odlišných fotosyntetických mikroorganismů v přirozených podmínkách, za proměnného světelného prostředí a za různých úrovní limitace živinami. Sleduje regulaci fotosyntézy na úrovni jednotlivých buněk i celých populací.