Autotrofní mikroorganismy (řasy a sinice) představují
zatím jen málo prozkoumaný zdroj bioaktivních látek.
Velká rozmanitost autotrofních mikroorganismů (v přírodě
existuje přes 120 tisíc známých druhů) představuje téměř
nevyčerpatelný zdroj přirozených sekundárních
metabolitů, které vykazují různé biologické aktivity
(např. protinádorové, protibakteriální, protiplísňové
nebo jako inhibitory různých enzymů). Detekci a izolaci
nových látek z autotrofních mikroorganismů komplikuje
fakt, že některé sekundární metabolity mohou být
syntetizovány pouze za určitých dobře definovaných
podmínek. Hlavní aktivita českého partnera projektu se
proto zaměřuje na vývoj a optimalizaci procesu přípravy
a izolace cenných látek, včetně jejich extrakce,
odebírání vzorků, kultivací a následného čištění hrubých
extraktů. Soubor čistých frakcí bude pak předán
rakouskému partnerovi pro testování biologických
aktivit.
Biotechnologická laboratoř v Třeboni začala s výzkumem v
oblasti získávání biologicky aktivních látek z
autotrofních mikroorganismů na počátku roku 2001.
Získávání nových chemických látek ze sekundárních
metabolitů autotrofních mikroorganismů umožní spojení
nedávno vyvinutých testovacích postupů založených na
imobilizovaných enzymech, které byly vyvinuty v české
laboratoři a technologií nanočipů, které jsou dostupné u
rakouského partnera projektu. Ke vzájemně výhodné
spolupráci přispěje i použití metody, která byla
vyvinuta v české partnerské laboratoři a která využívá
dereplikačních procedur na základě chemického screeningu
v kombinaci s diferenciací hrubých extraktorů, založené
na indexu podobnosti vhodné pro ranou fázi rozpoznání
hledaných látek.